
אוברטון משמשת כיום כסגנית מנהל המועצה למדיניות פנים בבית הלבן, והייתה מעורבת בכמה מהמהלכים הבולטים של טראמפ בתחום הבריאות. לפי הוול סטריט ג'ורנל, היא מילאה תפקיד מרכזי בזירוז הצו הנשיאותי שנועד לקדם מחקרים בסמים פסיכדליים כמו LSD ואיבוגאין, ולהאיץ את בחינתם של חומרים שקיבלו מעמד של "טיפול פורץ דרך".
אחד האנשים שדחפו את הנושא ישירות מול טראמפ היה הפודקאסטר ג'ו רוגן. לפי הדיווח, רוגן שלח לנשיא הודעת טקסט ובה נתונים על האפשרות שאיבוגאין יסייע בהפחתת ההתמכרות לאופיואידים. רוגן סיפר כי טראמפ השיב לו: "נשמע מצוין. אתה רוצה את אישור ה-FDA? בוא נעשה את זה". זמן קצר לאחר מכן חתם הנשיא על הצו, שאוברטון סייעה לקדם.

הנשיא טראמפ מינה את ד"ר היידי אוברטון לראשות ה-FDA, מינוי שיצטרך לעבור את אישור הסנאט
לצד תמיכתה במחקר הפסיכדלי, אוברטון מזוהה גם עם התנגדות לגלולות להפסקת היריון. אם מינויה יאושר, היא תעמוד בראש הגוף שבסמכותו לשנות את הכללים שהקלו בשנים האחרונות את הגישה לגלולות הללו. מתנגדי הפלות בארצות הברית דורשים מהממשל להגביל מרשמים מקוונים, שלטענתם מאפשרים לעקוף את חוקי ההפלות במדינות שבהן הוטלו הגבלות.
הסנאטורית הדמוקרטית פטי מארי מוושינגטון תקפה את המינוי וכינתה את אוברטון "קיצונית מהימין המתנגדת להפלות, שאין לה שום מקום בראש ה-FDA". גם הסנאטור הרפובליקני ביל קאסידי מלואיזיאנה, רופא ויו"ר ועדת הבריאות של הסנאט, הביע "חששות כבדים". לדבריו, היעדר ניסיון ניהולי והשתתפותה של אוברטון במהלך האחרון של טראמפ בנושא החיסונים הופכים את המינוי ל"כמעט בלתי מתקבל על הדעת".
אותו מהלך ביקש להפריד את החיסון המשולב נגד חצבת, חזרת ואדמת לשלושה חיסונים נפרדים, בניגוד לעמדת ארגונים רפואיים. אוברטון עמדה לצד טראמפ באירוע בבית הלבן שבו קידם את הצו, בזמן שהנשיא טען באופן שגוי כי מספר החיסונים או מועד קבלתם עשויים להיות קשורים לעלייה בשיעור האוטיזם. מחקרים שנערכו במשך עשרות שנים והקונצנזוס המדעי קבעו שאין קשר כזה.
טראמפ, שכינה אותה בפוסט ברשת Truth Social "ד"ר היידי", תיאר את אוברטון כ"כוכבת" חכמה ומוערכת שתפעל לקידום טיפולים מהירים יותר, חדשנות, הורדת מחירי התרופות והיעדים של תנועת "להחזיר את אמריקה לבריאות". שר הבריאות רוברט קנדי ג'וניור שיבח גם הוא את "שיקול הדעת יוצא הדופן, המקצועיות, המשמעת והמחויבות הבלתי מתפשרת שלה לעם האמריקאי".
אוברטון למדה רפואה באוניברסיטת ניו מקסיקו ומחזיקה בדוקטורט במחקר קליני מאוניברסיטת ג'ונס הופקינס. לפני שהצטרפה לממשל טראמפ שימשה מנהלת המדיניות במכון America First Policy Institute, מכון מחקר שמרני. בחודשים האחרונים הופיעה לצד הנשיא בהכרזות על הסכמים עם חברות תרופות להורדת מחירים ועל מדיניות החיסונים החדשה.
אם תאושר בסנאט, אוברטון תחליף את ד"ר מרטי מקארי, שהתפטר במאי והותיר אחריו שורה של סוגיות לא פתורות. בין היתר תידרש להתמודד עם בחינת תרופות נוגדות דיכאון, מדיניות החיסונים, הפיקוח על סיגריות אלקטרוניות, הגדרת מזון אולטרה-מעובד והדרישה להקל את הגישה לחומרים פפטידיים הפופולריים בקרב משפיעני בריאות וידוענים, אף שמדעני ה-FDA הזהירו כי יעילותם ובטיחותם טרם הוכחו.